除“設備交接單”、“場站收據”、“交接記錄”這三種主要單證外，集裝箱運輸通常還包括以下10種單證。

(1)訂艙單

訂艙單是船公司或其他承運人在接受發貨人(或托運人)的訂艙時，根據發貨人的口頭或書面申請，記載貨物托運的情況，用以安排集裝箱貨物運輸而制作的單證、訂艙單的主要內容有：貨名、件數、包裝式樣、標記、重量、尺碼、目的港、結匯期限、轉運期限、能否分批運輸、轉船運輸等。

(2)訂艙清單

訂艙清單是船公司或其代理公司根據訂艙單所記載的內容繪制的不同貨物的交接地、裝卸地一覽表。

(3)裝箱單

裝箱單是詳細記載每一個集裝箱內所裝貨物的名稱、數量及箱內貨物積載情況的唯一單證。在以集裝箱為單位進行運輸時，集裝箱裝箱單是一張極其重要的單證.它是貨物申報、交接等的依據，單證上所記載的貨物和集裝箱的重量是計算船舶吃水差和穩性的基本數據。當發生貨損、貨差時，它還是處理事故索賠的原始依據之一。

(4)批注清單

集裝箱碼頭堆場或集裝箱貨運站在接收貨物時，如發現貨物有異狀，則應將這一異狀的內容、程度記載在場站收據的備注欄，再根據這些內容編制成一份單證，這份單證就叫做批注清單。

(5)裝貨單

裝貨單是由承運人或其代理人簽字蓋章的單證，既是貨物辦理托運的憑證.又是通知船上接受承運貨物裝船的憑證。

(6)裝貨清單

裝貨清單是由承運人或其代理人根據本航次所托運的貨物。按先后到港次序把性質相近的貨物加以歸類后制成一張裝貨單的匯總清單。

(7)提單

提單是由集裝箱運輸經營人或其代理人在收到或接管貨物后簽發給發貨人或托運人的一種憑證，證明運輸物品已被接收或裝船，并待進海上運輸后，在指定港口把貨物交給正當的提單持有人的一種有價證券.也是運輸公司和貨主間的一種運輸合同，體現來了所記載的貨物方向的權利，通常通過背書的方式流通，是押匯票據的主要附屬單據，分為裝貨提單和收貨待運提單。

(8)空箱交接單

空箱交接單是貨主使用船公司的集裝箱時填寫的單證，船公司依據此指示集裝箱保管人將空箱交給此單證的持有人。

(9)保函

在集裝箱運輸過程中，承運人的責任是從接收貨物時算起，對貨物接收前已發生的貨物和集裝箱損害均詳細地記載有場站收據上，繼而將這一記載轉移至提單，從而在事實上構成不清潔提單。

(10)貨物托運單

集裝箱貨物托運單是指由托運人(發貨人或貨運代理人)根據頭實合同和信用證上的有關條款規定，向承運人或其代理人辦理貨物運輸的書面憑證。