電子結腸內窺鏡的生產許可證辦理需要按照相關法規和標準進行申請。具體辦理流程如下：

準備申請資料：包括企業工商營業執照、申報產品為第二類醫療器械的聲明、產品技術要求預評價報告、質量管理體系文件等。如果是自行生產，還需準備第二類醫療器械注冊證資料和生產許可資料；如果是委托生產，只需準備第二類醫療器械注冊證資料。

提交申請：將準備好的申請資料提交給省級或guojiaji藥品監督管理部門。

受理：藥品監督管理部門會對申請資料進行審查，符合要求的會受理。

現場檢查：藥品監督管理部門會對生產場所進行實地檢查，評估生產環境和設施是否符合規定。

審核與批準：經過審查和評估后，藥品監督管理部門會作出是否批準生產許可證的決定。

領取生產許可證：如果獲得批準，就可以領取電子結腸內窺鏡的生產許可證。