綠色工廠認證通常由的認證機構進行審核。這些機構負責評估工廠的環保和可持續發展實踐，確保其符合相關的綠色標準和法規。以下是一些可能執行綠色工廠認證審核的機構：

綠色建筑委員會（Green Building Councils）： 許多國家和地區都有綠色建筑委員會，例如美國的US Green Building Council（USGBC）、中國的中國綠色建筑委員會等。這些機構不僅關注建筑，也涉及到工廠和生產環節的綠色認證。

ISO認證機構： 化組織（ISO）發布了一系列與環境管理和可持續性相關的標準，如ISO 14001（環境管理體系認證）。一些綠色工廠可能通過ISO認證來展示其環保實踐。

環保組織和NGO： 一些環保組織和非政府組織（NGO）也可能執行綠色工廠認證審核。例如，世界自然基金會（WWF）和綠色和平等組織可能與工業企業合作，評估其環保表現。

行業協會： 特定行業的協會或組織也可能負責執行綠色工廠認證。這些協會了解特定行業的佳實踐，并確保其成員符合環保標準。

在選擇綠色工廠認證審核機構時，企業通常會考慮該機構的聲譽、性、認證標準的嚴格程度以及其在相關領域的經驗。