實驗室排風設備的數量及其排風量是實驗室空調系統設計考慮的重要因素，常見的實驗室排風設備包括排毒柜、萬向排煙罩、院子吸收罩、桌面通風罩、生物安全柜、抽風式試劑柜、通風的動物籠、手套箱等。實驗室空調系統的設計必須充分考慮實驗室的潛在熱源與冷源，以便計算出科學準確的冷量及采用變頻空調，達到節能的目的，實驗室常見的冷熱負荷包括人員顯熱、動物顯熱、實驗室儀器設備、計算機、燈光、冷房、暖房等。

為了降低實驗室對環境的污染，應把實驗室環保系統納入實驗室設計與建設中，使之成為實驗室必不可少的一部分，從而有利于貫徹落實各項實驗室環境污染的防治措施。實驗室廢氣，目前對氣態污染物的處理方法一般可分為濕法和干法兩大類，具體需要根據化學實驗室廢氣的特點來選擇高效率、低成本的方法，濕法廢氣處理、干法廢氣處理。廢水的處理方法有物理法、化學法、生物法，物理法主要利用物理作用以分離廢水中的懸浮物，化學法主要利用化學反應來處理廢水中的溶解物質或膠體物質，生物法是去除廢水中的膠體和溶解中的有機物質。對酸性廢水的處理，利用堿性廢水進行中和，使混合廢水PH值接近中性，在酸性廢水中投加中和劑，酸性廢水通過堿性濾層過濾中和；對堿性廢水的處理，利用酸性廢水進行中和，在堿性物質中投放酸性中和劑，向堿性廢水中鼓入煙道廢氣，利用水中二氧化碳中和堿性廢水；對于綜合廢液的處理，采用“水質均化+中和過濾→中和混凝→置換內電解→生物吸附池→沉淀池和清水池”工藝進行處理；在廢水處理中，為了保護PH值在線控制系統，采用中和過濾技術，保證酸堿廢水能穩定達標。

凈化工程中產生的少量濃縮液，可采用固化法處理，生物安全4級和生物安全3級實驗室的污水，必須進行消毒處理，經處理后，污水應符合《醫院污水排放標準》的規定。實驗室產生的固體廢物包括多余樣品、分析產物、消耗或破損的實驗用品、殘留或失效的化學試劑等，為了防止實驗室的污染擴散，對實驗室固體廢物的一般處理原則為分類收集、存放、處理，盡可能采用廢物回收以及固化、焚燒處理，在實際工作中選擇合適的方法進行檢測，盡可能減少廢物量、減少污染，廢棄物排放應符合國有有關環境排放標準。

實驗室供氣系統按其供應方式可分為分散供氣與集中供氣。分散供氣是將氣瓶或氣體發生器分別放在各個儀器分析室，接近儀器用氣點，使用方便，節約用氣，投資少；氣瓶柜應設有氣瓶安全提示標志，氣瓶安全規定裝置。集中供氣是將各種實驗分析儀器需要使用的二類氣體鋼瓶，全部放置在實驗室以外獨立的氣瓶間內，進行集中管理，各類氣體從氣瓶間以管道輸送形式，按照不同實驗儀器的用氣要求輸送到每個實驗室不同的實驗儀器上；整套系統包括氣源集合壓力控制部分、輸氣管線部分、二次調壓分流部分以及與儀器連接的終端部分；整套系統要求具有良好的氣密性、高潔凈度、耐用性和安全可靠性，能滿足實驗儀器對各類氣體不間斷連續使用的要求，并且在使用過程中根據實驗儀器工作條件對整體或局部氣體壓力、流量進行全量程調整以滿足不同的實驗條件的要求；集中供氣可實現氣源集中管理，遠離實驗室，保障實驗人員的安全，但供氣管道長，導致浪費氣體，開啟或關閉氣源要到氣瓶間，使用欠方便。